甜瓜因生长在早春日光温室中，处于高湿低温状态下，极易产生病害。栽培中常见的病害有枯萎病、细菌性角斑病和炭疽病；虫害主要是蚜虫和白粉虱。枯萎病可用70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液，或95%绿亨一号3000倍液灌根，并进行涂茎防治；细菌性角斑病可用77%可杀得可湿性粉剂500倍液，或新植霉素5000倍液喷防，连喷2——3次；炭疽病可用10%苯醚甲环唑水分散粒剂1000倍液，或2%加收米水剂600倍液喷防。蚜虫和粉虱以预防为主，可用30目防虫网隔离；药剂防治可用20%吡虫啉乳油2000倍液，或25%噻虫嗪水分散粒剂3500倍液喷雾。为提高防治效果，避免病虫对药剂产生抗性，应交替轮换用药。